Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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