Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SbdsP70122 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SbdsP70122 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SbdsP70122 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SbdsP70122 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SbdsP70122 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SbdsP70122 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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