Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Crip1P63254 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Crip1P63254 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms