Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rps29P62274 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rps29P62274 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Rps29P62274 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms