Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ufm1P61961 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms