Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Vbp1P61759 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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