Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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