Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CntfP51642 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CntfP51642 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CntfP51642 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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