Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbrP50284 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbrP50284 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms