Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Tmod1P49813 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Tmod1P49813 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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