Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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