Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkcdP28867 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms