Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RxraP28700 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
RxraP28700 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
RxraP28700 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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RxraP28700 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RxraP28700 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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