Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Rmdn2-201ENSMUST00000040368 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Clk1P22518 9230112E08Rik-202ENSMUST00000189441 3352 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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