Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pou3f1P21952 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms