Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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