Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms