Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fcer1aP20489 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms