Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TP20293 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TP20293 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TP20293 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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