Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnnc1P19123 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms