Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sptan1P16546 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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