Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm37813-201ENSMUST00000195003 3695 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Sdc2-201ENSMUST00000022871 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Il20rb-201ENSMUST00000098458 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms