Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tgfb1P04202 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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