Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ifnb1P01575 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ifnb1P01575 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ifnb1P01575 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ifnb1P01575 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Ifnb1P01575 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifnb1P01575 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms