Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MscO88940 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MscO88940 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MscO88940 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MscO88940 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MscO88940 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MscO88940 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MscO88940 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MscO88940 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MscO88940 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MscO88940 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MscO88940 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MscO88940 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MscO88940 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MscO88940 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
MscO88940 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MscO88940 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MscO88940 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MscO88940 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MscO88940 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MscO88940 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MscO88940 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
MscO88940 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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