Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Edil3O35474 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms