Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubgcp6G5E8P0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms