Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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H2-M1F7CXU4 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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H2-M1F7CXU4 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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H2-M1F7CXU4 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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H2-M1F7CXU4 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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H2-M1F7CXU4 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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H2-M1F7CXU4 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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H2-M1F7CXU4 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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