Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms