Protein–RNA interactions for Protein: F6XK35

Gm21876, Predicted gene, 21876, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21876F6XK35 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21876F6XK35 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21876F6XK35 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms