Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3543D3Z235 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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