Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rnf217D3YYI7 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf217D3YYI7 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf217D3YYI7 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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