Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Phf11bB4XVQ1 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Phf11bB4XVQ1 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Phf11bB4XVQ1 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Phf11bB4XVQ1 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Phf11bB4XVQ1 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Phf11bB4XVQ1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Phf11bB4XVQ1 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Phf11bB4XVQ1 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phf11bB4XVQ1 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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