Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Olfr1032-203ENSMUST00000111589 1393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm7684-201ENSMUST00000211891 829 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms