Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms