Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprsB0V2N1 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms