Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Prr16A3KMN5 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Prr16A3KMN5 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Prr16A3KMN5 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Prr16A3KMN5 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Prr16A3KMN5 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Prr16A3KMN5 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Prr16A3KMN5 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Prr16A3KMN5 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Prr16A3KMN5 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Prr16A3KMN5 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Prr16A3KMN5 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Prr16A3KMN5 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Prr16A3KMN5 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Prr16A3KMN5 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prr16A3KMN5 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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