Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GabreA2AMW3 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms