Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms