Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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