Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Znf346Q9R0B7 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Znf346Q9R0B7 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Znf346Q9R0B7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Znf346Q9R0B7 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Znf346Q9R0B7 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Znf346Q9R0B7 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Znf346Q9R0B7 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Znf346Q9R0B7 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Znf346Q9R0B7 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Znf346Q9R0B7 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Znf346Q9R0B7 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Znf346Q9R0B7 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Znf346Q9R0B7 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms