Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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