Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms