Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Usp29Q9ES63 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Usp29Q9ES63 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Usp29Q9ES63 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Usp29Q9ES63 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms