Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms