Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms