Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Trp63-203ENSMUST00000115304 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gtf3c6Q9D8P7 Il17rd-205ENSMUST00000226105 2923 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gtf3c6Q9D8P7 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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