Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Nop56Q9D6Z1 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Nop56Q9D6Z1 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Nop56Q9D6Z1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Nop56Q9D6Z1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Nop56Q9D6Z1 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Nop56Q9D6Z1 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Nop56Q9D6Z1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
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Nop56Q9D6Z1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
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