Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Snapc3Q9D2C9 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms