Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Zbed3Q9D0L1 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Zbed3Q9D0L1 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Zbed3Q9D0L1 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Zbed3Q9D0L1 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zbed3Q9D0L1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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